El sub-tronco de lenguas maipureano (en portugués tronco maipúre), 4.500 años de diversificación lingüística, consiste de 65 lenguas de las cuales 31 están muertas, siendo el tronco más grande de lenguas del Nuevo Mundo y con una considerable ramificación.

Su clasificación es como sigue:

• División septentrional

•      Rama Alto Amazonas

•          Sub-rama nawiki occidental

•              Grupo wainumá

•                 Lengua wainumá

•                  Lengua mariaté

•                  Lengua anauyá

•              Grupo piapoko

•                  Lengua achawa

•                  Lengua piapoko

•                  Lengua amarizana

•                  Lengua kaviyarí

•              Grupo warekena

•                  Lengua warekena

•                  Lengua mandawaka

•              Grupo río negro

•                  Lengua jumana

•                  Lengua pasé

•                  Lengua kaiwishana

•                  Lengua jukuna

•                  Lengua emergente jukuna

•                  Lengua emergente garú

•          Sub-rama nawiki oriental

•              Lengua tariana

•              Lengua karu

•                  Dialecto ipeka-kurripako

•                  Dialecto karútana-baniwa

•                  Dialecto katapolítani-moriwene-mapanai

•              Lengua resígaro

•          Sub-rama alto Amazonas central

•              Grupo baré

•                  Lengua marawá

•                  Lengua baré

•                  Lengua ginao

•              Grupo yavitero

•                  Lengua yavitero

•                  Lengua baniva

•                  Lengua maipure

•              Grupo manao

•                  Lengua manao

•                  Lengua kariaí

•                  Lengua waraikú

•                  Lengua yabaána

•                  Lengua wiriná

•                  Lengua shiriana

•      Rama marítima

•          Lengua aruán

•          Lengua wapishana

•          Sub-rama ta-maipueran

•              Lengua taíno

•              Lengua wahiro

•              Lengua parahuano

•              Lengua arawák

•              Lengua inyeri

•              Lengua emergente kalhíphona

•              Lengua emergente garífuna

•      Rama oriental

•          Lengua palikur

•          Lengua emergente palikur

•          Lengua emergente marawán-karipurá

• División meridional

•      Rama occidental

•          Lengua amoesha

•          Lengua chamikuro

•      Rama central

•          Grupo paresí

•              Lengua paresí

•              Lengua sarave

•          Grupo waurá

•              Lengua waurá-meinaku

•              Lengua yawalapití

•              Lengua kustenau

•      Rama meridional exterior

•          Lengua terena

•          Grupo moho

•              Lengua moho

•              Lengua emergente ignaciano

•              Lengua emergente trinitario

•              Lengua banure

•              Lengua pauna-paikone

•          Grupo piro

•              Lengua piro

•              Lengua inapari

•              Lengua kanamaré

•              Lengua apuriná

•      Rama kampa

•          Lengua emergente ashéninga

•          Lengua emergente asháninga

•          Lengua emergente matsigenga